Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGB4P16144 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms