Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CALUO43852 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALUO43852 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALUO43852 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CALUO43852 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CALUO43852 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALUO43852 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALUO43852 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALUO43852 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALUO43852 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALUO43852 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms