Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf170A2RU37 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms