Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPA3P35244 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPA3P35244 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPA3P35244 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms