Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTA1P68133 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms