Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACTC1P68032 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms