Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNRPNP63162 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNRPNP63162 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms