Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA2P29317 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms