Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SERP1Q9Y6X1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
SERP1Q9Y6X1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1061.9 ms