Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHB2Q9Y5E7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PCDHB2Q9Y5E7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PCDHB2Q9Y5E7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms