Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4Z2

NEUROG3, Neurogenin-3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROG3Q9Y4Z2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROG3Q9Y4Z2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEUROG3Q9Y4Z2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEUROG3Q9Y4Z2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms