Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNEQ9Y223 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNEQ9Y223 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GNEQ9Y223 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GNEQ9Y223 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GNEQ9Y223 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GNEQ9Y223 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GNEQ9Y223 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GNEQ9Y223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GNEQ9Y223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GNEQ9Y223 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GNEQ9Y223 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GNEQ9Y223 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GNEQ9Y223 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GNEQ9Y223 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GNEQ9Y223 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GNEQ9Y223 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GNEQ9Y223 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GNEQ9Y223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GNEQ9Y223 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms