Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SCAF8Q9UPN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SCAF8Q9UPN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCAF8Q9UPN6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCAF8Q9UPN6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms