Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHORDC1Q9UHD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHORDC1Q9UHD1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
CHORDC1Q9UHD1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHORDC1Q9UHD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms