Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNRD1Q9P1U0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ZNRD1Q9P1U0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ZNRD1Q9P1U0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms