Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RRN3Q9NYV6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RRN3Q9NYV6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RRN3Q9NYV6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
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