Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP39A1Q9NYL5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYP39A1Q9NYL5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms