Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLCO1C1Q9NYB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLCO1C1Q9NYB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO1C1Q9NYB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms