Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDX43Q9NXZ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDX43Q9NXZ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DDX43Q9NXZ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DDX43Q9NXZ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms