Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
BSDC1Q9NW68 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BSDC1Q9NW68 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
BSDC1Q9NW68 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
BSDC1Q9NW68 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms