Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4GQ9NTN9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4GQ9NTN9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEMA4GQ9NTN9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEMA4GQ9NTN9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms