Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAD18Q9NS91 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAD18Q9NS91 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAD18Q9NS91 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAD18Q9NS91 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms