Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMPRSS4Q9NRS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMPRSS4Q9NRS4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMPRSS4Q9NRS4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms