Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ASCL3Q9NQ33 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ASCL3Q9NQ33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ASCL3Q9NQ33 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms