Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE3

NOP10, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP10Q9NPE3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOP10Q9NPE3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOP10Q9NPE3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NOP10Q9NPE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms