Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAT1LQ9HCJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VAT1LQ9HCJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VAT1LQ9HCJ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms