Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZNF408Q9H9D4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZNF408Q9H9D4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF408Q9H9D4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF408Q9H9D4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms