Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRDE2Q9H7Z3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRDE2Q9H7Z3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRDE2Q9H7Z3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
NRDE2Q9H7Z3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms