Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHX3Q9H6B9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHX3Q9H6B9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPHX3Q9H6B9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms