Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM12Q9H4Q4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PRDM12Q9H4Q4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PRDM12Q9H4Q4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms