Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG10Q9H0Y0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG10Q9H0Y0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATG10Q9H0Y0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATG10Q9H0Y0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms