Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2OQ9C0C9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2OQ9C0C9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
UBE2OQ9C0C9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms