Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FOXQ1Q9C009 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FOXQ1Q9C009 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOXQ1Q9C009 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms