Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC46A2Q9BY10 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC46A2Q9BY10 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC46A2Q9BY10 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms