Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NUSAP1Q9BXS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUSAP1Q9BXS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUSAP1Q9BXS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NUSAP1Q9BXS6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUSAP1Q9BXS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NUSAP1Q9BXS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms