Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYT17Q9BSW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYT17Q9BSW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SYT17Q9BSW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYT17Q9BSW7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYT17Q9BSW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms