Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UTP23Q9BRU9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTP23Q9BRU9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP23Q9BRU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms