Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 GIPC1-206ENST00000587210 576 ntTSL 512.85□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 33.1
BUD13Q9BRD0 FBXO9-207ENST00000473318 574 ntTSL 310.07□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 33.1
BUD13Q9BRD0 FBXO9-211ENST00000484436 634 ntTSL 56.71□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 33.1
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.018e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-209ENST00000587602 3875 ntTSL 214.7□□□□□ -0.068e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.138e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 LIG1-219ENST00000600055 602 ntTSL 217.17■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.923e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-218ENST00000521459 714 ntTSL 524.03■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 523.92■■□□□ 1.423e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 522.75■■□□□ 1.233e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-206ENST00000429013 896 ntTSL 520.49■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-209ENST00000457935 1091 ntTSL 515.46■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 534.17■■■■□ 3.063e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.415e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)22.52■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.815e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 ANKRD10-203ENST00000460846 535 ntTSL 315.18■□□□□ 0.023e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 FAM13A-204ENST00000502914 587 ntTSL 47.14□□□□□ -1.272e-7■■■■■ 33
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.631e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.631e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)25.03■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)25.03■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)20.41■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 RNF220-216ENST00000488865 860 ntTSL 230.54■■■□□ 2.485e-7■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 RNF220-208ENST00000471494 720 ntTSL 527.02■■□□□ 1.925e-7■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 RNF220-218ENST00000497469 590 ntTSL 218.17■□□□□ 0.52e-8■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 RNF220-206ENST00000453863 361 ntTSL 310.27□□□□□ -0.775e-7■■■■■ 32.9
BUD13Q9BRD0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.24e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 SUN2-213ENST00000464202 541 ntTSL 221.28■■□□□ 14e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LINC00969-206ENST00000425425 525 ntTSL 221.17■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.534e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.454e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.074e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.034e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-201ENST00000380962 1529 ntTSL 214.44□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-204ENST00000564011 1168 ntTSL 512.55□□□□□ -0.44e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-219ENST00000636433 1444 ntTSL 512.2□□□□□ -0.464e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-205ENST00000570981 612 ntTSL 211.66□□□□□ -0.544e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-212ENST00000576625 640 ntTSL 510.48□□□□□ -0.734e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 ZNF514-203ENST00000447814 554 ntTSL 49.4□□□□□ -0.94e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-206ENST00000480775 713 ntTSL 1 (best)9.01□□□□□ -0.974e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 COPS3-215ENST00000578317 1625 ntTSL 28.58□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 ADSL-216ENST00000625194 1079 ntTSL 58.35□□□□□ -1.074e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 COPS3-203ENST00000439936 1394 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.074e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 COPS3-216ENST00000579716 419 ntTSL 27.68□□□□□ -1.184e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 CARD8-201ENST00000377461 3325 ntTSL 27.6□□□□□ -1.194e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 LCMT1-211ENST00000576382 260 ntTSL 36.57□□□□□ -1.364e-9■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 COPS3-208ENST00000486032 725 ntTSL 26.15□□□□□ -1.424e-9■■■■■ 32.8
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BUD13Q9BRD0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-13■■■■■ 32.8
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BUD13Q9BRD0 HSD17B7-201ENST00000254521 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-8■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 MAGED2-210ENST00000487463 376 ntTSL 210.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 32.8
BUD13Q9BRD0 PGK1-203ENST00000476531 960 ntTSL 212.45□□□□□ -0.424e-39■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 SHARPIN-205ENST00000531375 613 ntTSL 230.25■■■□□ 2.438e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.198e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.098e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.048e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 ZBTB17-209ENST00000474511 794 ntTSL 326.34■■□□□ 1.815e-8■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 LINC-PINT-202ENST00000423414 616 ntTSL 426.09■■□□□ 1.778e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 C16orf59-208ENST00000567489 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 325.67■■□□□ 1.78e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.688e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 LINC-PINT-204ENST00000431189 803 ntTSL 325.48■■□□□ 1.678e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 CEP250-212ENST00000476146 550 ntTSL 424.91■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.548e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 C16orf59-209ENST00000568753 650 ntAPPRIS ALT2 TSL 324.16■■□□□ 1.468e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WDR13-208ENST00000486125 936 ntTSL 224.09■■□□□ 1.456e-9■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WDR13-212ENST00000498631 859 ntTSL 224.09■■□□□ 1.451e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 RPUSD3-205ENST00000427174 907 ntTSL 524.04■■□□□ 1.448e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 GATC-202ENST00000548171 931 ntTSL 223.92■■□□□ 1.421e-12■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 WDR13-205ENST00000472440 430 ntTSL 223.7■■□□□ 1.388e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 RPUSD3-213ENST00000472381 823 ntTSL 523.59■■□□□ 1.378e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 423.53■■□□□ 1.368e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 RPUSD3-210ENST00000460909 578 ntTSL 223.16■■□□□ 1.38e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 TMEM132A-205ENST00000536409 454 ntTSL 323.09■■□□□ 1.298e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MELTF-205ENST00000473501 2757 ntTSL 223.07■■□□□ 1.288e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 MUTYH-208ENST00000435155 904 ntTSL 522.93■■□□□ 1.268e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 C16orf59-213ENST00000569994 2156 ntTSL 222.93■■□□□ 1.268e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.198e-7■■■■■ 32.7
BUD13Q9BRD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.188e-7■■■■■ 32.7
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