RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568753.1

C16orf59-209, Transcript of Uncharacterized protein C16orf59, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene C16orf59, Length 650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf59-209ENST00000568753 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.73■■■■■ 5.71
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C16orf59-209ENST00000568753 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.75■■■■■ 4.59
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C16orf59-209ENST00000568753 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.79■■■■■ 4.28
C16orf59-209ENST00000568753 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.71■■■■■ 4.27
C16orf59-209ENST00000568753 SCRIBQ14160 1630 aa41.6■■■■■ 4.25
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C16orf59-209ENST00000568753 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.84■■■■■ 4.13
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C16orf59-209ENST00000568753 HMGXB3Q12766 1538 aa39.64■■■■□ 3.94
C16orf59-209ENST00000568753 NESP48681 1621 aa39.62■■■■□ 3.93
C16orf59-209ENST00000568753 SMARCA4P51532 1647 aa39.59■■■■□ 3.93
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C16orf59-209ENST00000568753 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.16■■■■□ 3.86
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C16orf59-209ENST00000568753 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.87■■■■□ 3.81
C16orf59-209ENST00000568753 TRIM41Q8WV44 630 aa38.87■■■■□ 3.81
C16orf59-209ENST00000568753 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.74■■■■□ 3.79
C16orf59-209ENST00000568753 WDR62O43379 1518 aa38.59■■■■□ 3.77
C16orf59-209ENST00000568753 WIZO95785 1651 aa38.49■■■■□ 3.75
C16orf59-209ENST00000568753 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.47■■■■□ 3.75
C16orf59-209ENST00000568753 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.41■■■■□ 3.74
C16orf59-209ENST00000568753 OSCARQ8IYS5 282 aa38.36■■■■□ 3.73
C16orf59-209ENST00000568753 CFTRP13569 1480 aa38.3■■■■□ 3.72
C16orf59-209ENST00000568753 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.16■■■■□ 3.7
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C16orf59-209ENST00000568753 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.7■■■■□ 3.63
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C16orf59-209ENST00000568753 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.66■■■■□ 3.62
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C16orf59-209ENST00000568753 TOPBP1Q92547 1522 aa37.59■■■■□ 3.61
C16orf59-209ENST00000568753 ARHGEF11O15085 1522 aa37.56■■■■□ 3.6
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C16orf59-209ENST00000568753 ARAP1Q96P48 1450 aa37.18■■■■□ 3.54
C16orf59-209ENST00000568753 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
C16orf59-209ENST00000568753 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.12■■■■□ 3.53
C16orf59-209ENST00000568753 SOGA1O94964 1423 aa37.1■■■■□ 3.53
C16orf59-209ENST00000568753 CHD1O14646 1710 aa37.09■■■■□ 3.53
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C16orf59-209ENST00000568753 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.8■■■■□ 3.48
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C16orf59-209ENST00000568753 GRIN2BQ13224 1484 aa36.78■■■■□ 3.48
C16orf59-209ENST00000568753 WDR97A6NE52 1622 aa36.76■■■■□ 3.48
C16orf59-209ENST00000568753 CUX1P39880 1505 aa36.75■■■■□ 3.47
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C16orf59-209ENST00000568753 SYNJ2O15056 1496 aa36.7■■■■□ 3.47
C16orf59-209ENST00000568753 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.58■■■■□ 3.45
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C16orf59-209ENST00000568753 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.43■■■■□ 3.42
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C16orf59-209ENST00000568753 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.23■■■■□ 3.39
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C16orf59-209ENST00000568753 CEP170Q5SW79 1584 aa36.12■■■■□ 3.37
C16orf59-209ENST00000568753 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.11■■■■□ 3.37
C16orf59-209ENST00000568753 ADAMTS12P58397 1594 aa36.09■■■■□ 3.37
C16orf59-209ENST00000568753 JPH4Q96JJ6 628 aa35.96■■■■□ 3.35
C16orf59-209ENST00000568753 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
C16orf59-209ENST00000568753 TOP2BQ02880 1626 aa35.94■■■■□ 3.34
C16orf59-209ENST00000568753 SHROOM2Q13796 1616 aa35.94■■■■□ 3.34
C16orf59-209ENST00000568753 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
C16orf59-209ENST00000568753 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.87■■■■□ 3.33
C16orf59-209ENST00000568753 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
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