Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MGME1Q9BQP7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MGME1Q9BQP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MGME1Q9BQP7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MGME1Q9BQP7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MGME1Q9BQP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MGME1Q9BQP7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MGME1Q9BQP7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MGME1Q9BQP7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms