Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RETNLBQ9BQ08 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RETNLBQ9BQ08 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms