Protein–RNA interactions for Protein: Q99788

CMKLR1, Chemokine-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMKLR1Q99788 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMKLR1Q99788 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMKLR1Q99788 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CMKLR1Q99788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMKLR1Q99788 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms