Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MTRQ99707 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MTRQ99707 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MTRQ99707 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
MTRQ99707 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTRQ99707 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MTRQ99707 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MTRQ99707 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MTRQ99707 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MTRQ99707 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MTRQ99707 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MTRQ99707 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTRQ99707 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTRQ99707 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MTRQ99707 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTRQ99707 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTRQ99707 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTRQ99707 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTRQ99707 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MTRQ99707 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MTRQ99707 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTRQ99707 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTRQ99707 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTRQ99707 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTRQ99707 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTRQ99707 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MTRQ99707 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTRQ99707 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MTRQ99707 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
MTRQ99707 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTRQ99707 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MTRQ99707 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTRQ99707 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MTRQ99707 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MTRQ99707 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MTRQ99707 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTRQ99707 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MTRQ99707 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTRQ99707 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MTRQ99707 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTRQ99707 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MTRQ99707 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MTRQ99707 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MTRQ99707 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MTRQ99707 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTRQ99707 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MTRQ99707 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTRQ99707 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTRQ99707 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTRQ99707 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTRQ99707 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTRQ99707 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MTRQ99707 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTRQ99707 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTRQ99707 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTRQ99707 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MTRQ99707 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MTRQ99707 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTRQ99707 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTRQ99707 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTRQ99707 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MTRQ99707 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTRQ99707 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTRQ99707 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTRQ99707 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MTRQ99707 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTRQ99707 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTRQ99707 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MTRQ99707 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MTRQ99707 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms