Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NOTCH4Q99466 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NOTCH4Q99466 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOTCH4Q99466 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOTCH4Q99466 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
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