Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM209Q96SK2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM209Q96SK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM209Q96SK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM209Q96SK2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms