Protein–RNA interactions for Protein: Q96S55

WRNIP1, ATPase WRNIP1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNIP1Q96S55 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
WRNIP1Q96S55 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WRNIP1Q96S55 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
WRNIP1Q96S55 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WRNIP1Q96S55 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WRNIP1Q96S55 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms