Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMTK3Q96Q04 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
LMTK3Q96Q04 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMTK3Q96Q04 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
LMTK3Q96Q04 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMTK3Q96Q04 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
LMTK3Q96Q04 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.8 ms