Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT5

SLC46A1, Proton-coupled folate transporter, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A1Q96NT5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC46A1Q96NT5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC46A1Q96NT5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC46A1Q96NT5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms