Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COG8Q96MW5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COG8Q96MW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COG8Q96MW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COG8Q96MW5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms