Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
EP400Q96L91 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EP400Q96L91 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EP400Q96L91 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EP400Q96L91 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
EP400Q96L91 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms